近期,中科院合肥研究院智能所黃青研究員課題組利用紅外和拉曼光譜識別賴氨酸乙?;卣鳎瑸樯锵到y(tǒng)中蛋白質(zhì)乙?;Y(jié)構(gòu)分析提供了理論和實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在國際光譜專業(yè)期刊Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy上。
乙?;巧飳W(xué)中常見且極其重要的蛋白質(zhì)修飾,在細(xì)胞代謝中都起著關(guān)鍵性的調(diào)節(jié)作用。蛋白質(zhì)乙?;袃煞N方式,一是賴氨酸殘基特有的
乙?;?,二是多種氨基酸殘基都可發(fā)生的N-末端
乙?;D壳耙话阌肗-末端乙酰轉(zhuǎn)移酶來標(biāo)記判斷賴氨酸殘基是否發(fā)生
乙?;摲椒ǖ臏?zhǔn)確性仍存在爭議。在分子水平識別蛋白質(zhì)乙?;悄壳把芯刻魬?zhàn)之一,其關(guān)鍵是對賴氨酸的乙?;M(jìn)行準(zhǔn)確定位表征,由此獲得清晰和系統(tǒng)的認(rèn)識。
針對這種情況,研究團(tuán)隊(duì)通過紅外和拉曼光譜實(shí)驗(yàn)以及密度函數(shù)理論(DFT)計(jì)算,系統(tǒng)地研究L-賴氨酸三種乙?;愋?
、
和
)的結(jié)構(gòu)變化及相應(yīng)的振動光譜特征,發(fā)現(xiàn)酰胺基、羧基等基團(tuán)的紅外和拉曼特征譜帶能用于有效識別不同的乙?;愋汀Q言之,從紅外和拉曼光譜特征即可判斷賴氨酸是否乙酰化,也可判斷賴氨酸發(fā)生了
乙酰化,還是
乙酰化,或者
同時(shí)乙?;?。同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)對乙酰化的振動光譜識別策略在多肽模型中也得到驗(yàn)證。基于此,該項(xiàng)研究工作提供乙酰化賴氨酸的振動模式解析,并提出賴氨酸乙?;墓庾V識別和新的表征方法,為生物系統(tǒng)中蛋白質(zhì)乙?;Y(jié)構(gòu)分析提供了理論和實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
該研究工作得到了國家自然科學(xué)基金和安徽省自然科學(xué)基金的資助。
文章鏈接: https://doi.org/10.1016/j.saa.2022.121371
賴氨酸和三種乙酰化賴氨酸的分子結(jié)構(gòu)
Lys-G4多肽及其賴氨酸殘基乙?;睦碚撚?jì)算紅外光譜(紅色為
乙?;?,藍(lán)色為
乙?;?/span>
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